水に含まれるミネラル分や、鉄分等の金属イオンが付着したものと考えられます。白い浮遊物がお湯の中で浮いたり、サビ状の斑点（もらいさび）や、ざらざらしたものが内容器に付着することがあります。
また、水のつぎたしを繰り返し行うと、早く汚れる原因になります。１日に１回は残り湯を捨て、中をすすいでください。
内容器が汚れても衛生上問題ありませんが、湯わかし音が大きくなったり、蒸気がにおうことがありますので、定期的（１～２ヶ月に１回）にクエン酸洗浄を行ってください。
加湿器クエン酸洗浄方法(動画)

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